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这样经过整编之后，沐王府的军队也实现了真正的职能分离，也基本完成了以后军队主体构成的框架，将地方驻军与野战部队基本按照职能划分开来，理清了主次关系，明确了各自的作战任务，也相应的提升了战斗力，为以后的扩军行动奠定了基础。
借助整军的空闲时间，沐剑声还抽空把精力都从军事方面收回，投入到了眼下内部的各项建设和人员机构调整之中，对王府各个关键的文职进行了调整，以便进一步巩固加深自己的掌控力，维持自己在整个大明政权的核心地位，保证各项命令的贯彻执行。
按照沐剑声的思路，王府辖区分为闽粤琼台和吕宋、盘龙六个省，正式设立了省级职能部门，行政首脑为高官，主抓省内全面的工作，具体向中央负责，又设立藩台（高官）、布政使、转运使、提刑使为其副职，各自负责一部具体事务，牵制高官的权力。
这其中，广东省高官为白寒松兼任，福建省高官为顾炎武，吕宋省高官为唐甄，盘龙省高官为迪洛（当地土著首领），琼海省高官为李因笃，台湾省高官为陈近南。此外又设置后方的军事指挥首脑，职务为指挥使，其中吕宋指挥使为李西华兼任，琼海指挥使为刘富贵，盘龙指挥使苏况，台湾指挥使为沐雷，协助高官安顿地方。至于闽粤两省，因为属于作战前沿，由大本营统一指挥。之所以提升海南和台湾两个大岛为省级区划，也是为了突出其重要性，同时达到扩大省级编制数量的目的，给外人以强大的表象。
除了以上所安排人员，其余如钱忠、傅山、方以智、吴立身、朱俨堃、郑经、耿精忠、石影、金牧远、沐天池、史啸风、柳晟、高明扬、姜柯、赵俨、王熙、施世纶、文庄、宁源、谭忠、尚之平等人，也都被提升为中央的吏户礼兵刑工各部和正副省级官员，主管处理王府的全盘具体事务，这些人暂时组成了王府政权的核心领导阶层，管理各地，有力的保证了王府各项军政命令的实施。
在省以下，又设立有府衙，其首脑为知府，副职有同知、通判、提刑、推官等，分管各府的具体工作，对应省级和县级各职能部门，进行监督和牵制。在府以下设县，首脑为知县，副职为县丞、衙司、县尉、典吏等，分管各项具体工作；而在县级以下，则设有村镇两级组织机构，也算是最基层的官员了。
确定了行政级别和职能权限后，随后就只需要按照各人的贡献和具体能力予以任命即可。无论是王府的云南老臣，还是在琼州岛时新加入的人员，或者在吕宋时期加入的新人，只要有才能者，基本上各人都有所提升，也算是对这些人多年来矢志效忠王府的回报，这些人也算是王府的骨干人员，是沐剑声的各种计划进行实施的重要力量。当然仅有这些人员是不够的，毕竟王府这几年的扩张速度很快，好在近一两年时间里，大批的人员前来投奔王府，里面的各种人才着实不少，这些人在经过短暂的培训之后，就迅速走上了各个岗位，从而解决了王府的基层人才短缺问题。
眼下沐王府在闽粤两省的内政建设措施，基本上是将以前在琼州和吕宋所推行的各项政策按部就班，予以执行。而在福建这里，由于以前郑经和耿精忠等人所采取的一些措施，尤其是在起事之后，在福建台湾各地的满清势力和顽固势力大部分都被两人予以清剿，后来康亲王所部虽然占领了福建中北部，不过又很快被迫退出，根本就来不及改变这种状况，所以敌对力量十分薄弱，即便是有一些满清的溃兵遁入山林，不过多分散于各处山林茂密险要之处，和外界缺乏联系，物资补给很困难，难以造成大的危害，而这些人一旦露头，立刻会遭到明军的大力追剿，很难生存下去。
不过即便这样，这些残余的武装分子也给王府制造了很多麻烦，不时有敌对分子进行各种破坏活动，随后为了稳固闽粤两省的彻底安宁，保证生存活动的正常进行，巩固根据地的各项建设成果，王府大力展开了针对残敌的清剿，由于有原属天地会人员的大力配合，在沐王府军队和内卫人员的大力清剿下，这些人本身的战斗力也很差，面临这等力度极强的打击，很快所剩无几，最后趋于消亡。
剿灭了这些大大小小的敌对势力之后，闽粤两省的大环境就安稳了很多，社会秩序迅速恢复平静，再加上有了军队保驾护航，王府的各项政策推广实施十分顺利，而这些政策与王府在广东所推行的政策大同小异，主要还是围绕恢复农业民生、增开工厂、加强教育、改善城市环境建设等几个方面来进行。
在经过近一年的励精图治之后，沐王府基本完成了对这些地盘的掌控，成功的建立了各级政权机构，迅速恢复了各项民生和地方建设，其中安顿了十多万因战争而产生的流民，恢复荒置田地超过百万亩，新开垦田地超过四十万亩，建成小型加工厂、养殖厂、副食品工厂等近百家，从而迅速恢复了经济秩序，取得了当地老百姓的支持。
随着各项工作有力的开展和完成，王府对于闽粤两省的统治已经稳如磐石，在这种有利的局面下，大明复兴监国二年五月初（西元1679年），大明南海郡王、总理大臣、天下兵马大元帅沐剑声亲自带兵进攻江西，正式拉开了沐王府挺进北方的序幕。
不过在此之前，远在北方的平凉城，一代枭雄王辅臣也终于走到人生的终点。由于内奸的配合，清兵终于打破了城门，随着平凉城被清兵攻破，眼看大势已去，于是他也在府衙里引鸩自尽。与真实历史不同的是，他败亡的时间推迟了将近三年的时间，而且其手下的几名心腹偏将带领少数精锐，裹挟护送着其子王吉贞及一些家属，携带着部分金银细软财物连夜突围逃进深山。其后，这些人又逃窜进入北方草原，不知所踪，图海与赵良栋的军队虽然取得了最终胜利，然而依旧未尽全功，留下了一些隐患。
不过欺上瞒下自古皆然，图海在报捷奏折上也隐去了这些不足，并且斩下王辅臣的首级，送到京师请功。因此当北京城的康熙看到了王辅臣的首级，得知平定平凉的消息后极为高兴，于是下令重重嘉奖他们，同时下令让他们修整些时日后迅速西进，与张勇部协作进兵，彻底剿灭反叛的海西和凉州蒙古各部，然后再南下平定王屏藩，向汉中和甘南进击，这样以来，吴军的西线压力陡增，形势变得严峻起来。
另外一个消息就是，由于葛尔丹继承了西蒙古准格尔部的汗位，并和密宗大师桑结部结为同盟，他随后宣布以密宗为准格尔汗国国教，授予桑结大师‘准格尔国师’与‘护国活佛’的称号，从而取得了整个密宗的有力支持，两方势力结盟之后，葛尔丹的实力大增，为他掌控准格尔部打下基础。
这个消息传到沐剑声耳朵之后，他立刻明白，自己的另外一个对手葛尔丹也到了台前，走上了迅速的崛起之路。好在沐剑声之前已经有力预判，沐王府在几年之前就已经有了针对性的策略，提前安插了一些棋子，所以也不怕此人有什么不利于王府的动作。
还有另外一个重要的情报，那就是在遥远的北海地区，罗刹人骑兵终于大批的出现，他们穿过北海，开始对漠北的喀尔喀三部蒙古人展开了攻击。上万名哥萨克骑兵分为数队，在喀尔喀境内四下劫掠，抢夺财物，无恶不作，最远的甚至深入到了黑龙江中下游区域。
由于对方装备了火枪，而且剽悍异常，所以喀尔喀部数次与之交战尽皆告负，眼见罗刹人步步紧逼，整个北海四周和黑龙江中上游区域，已经完全的落到了罗刹人手中。他们的目标很明确，就是要夺取北海南面的广大土地，获取稳固的东进通道，进而把整个西伯利亚地区据为己有，并伺机南下，威胁清廷的根本。
对于罗刹人的贪婪，沐剑声极为清楚，这个在历史上对华夏伤害最深的民族，他们对于土地的渴望是极其变态的，所以为了遏制对方的发展，取得未来整个战略态势的主动，自己必须要有所行动才是。
虽然眼下自家的势力范围还远在岭南，实力也还有限，不足以逆转这种局面，不过只要策略得当，采用合适的合纵连横，也可以借用别人的力量，拖延罗刹人的扩张脚步，延缓北方地区的沦陷时间，为自家争取到几年关键的时间。