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神庭越近，时间过得越快，在九黎部落还不知道首领哪去了，还不来帮忙时，黄帝已经率领轩辕部落支援其实早就支离破碎的神农氏王朝，因为神农氏王朝就靠神农氏一人撑起。
黄帝出生时海角的应龙应气运现世，很多时候黄帝只是扮演运筹帷幄的角色，没人知道黄帝实力如何，只知道他是一个十分擅长用人的部落首领。
如果说炎帝是靠硬实力，蚩尤是靠战术和先进的炼金技术，黄帝靠的就是以德服人和用人之道，周边的人对他服服帖帖，而黄帝也没让人族失望，挑起大量，指挥应龙将天罡地煞一百多个恶神吞掉，并且亲自击败应龙也不是其对手的烛九阴。
烛九阴是九黎部落这边的，以前跟公共时杀了无数人，后面跟九黎部落的蚩尤后也没抛头露面几次，所以本能的被黄帝认为是恶神。
烛九阴最后决定归附于黄帝之下，一是因为应龙是他妹妹，另外就是首领不知道去哪了，他得有靠山，否则以他之前的所作所为，会被这个年轻气盛，有王者之志的轩辕氏给当场抹杀！
蚩尤再次出现时已经把绝大多数的恶神都给斩杀，共工这个势利眼也对蚩尤表示臣服，众人欢呼，而炎帝也最后一次轮回重生，中华三祖的名头也就来了。
只是蚩尤对恶神可谓是恨之入骨，为了确保人间不会再有瘟疫直接杀了瘟神，共工见到苗头不对立马又对曾经的主子炎帝表示臣服，并且叫炎帝为臣父，自称为臣子，而炎帝还是性格太温和了，说如果共工死了浩瀚海洋无人管，会吞噬所有人赖以生存的大陆，故此，公共活了下来。
随后蚩尤号令天下部落来到云梦泽，一一处决剩余恶神，被包括神农氏王朝和新建的轩辕王朝在内的所有部落称之为主兵之神，因为主兵戈，恶神都畏惧之。
并且立志，神无道，人间怨，他势必会杀掉诸神，赢得喝彩。
炎帝呢，继续尝百草，寻找在他眼里能养得活适合大面积耕作的灵根。
黄帝呢，大力发展生产，始制衣冠、建舟车、制音律、作《 黄帝内经 》
蚩尤开始一一杀向无辜善神，在除开九黎部落以外的部落里，人们对主兵之神这种行为持保留意见，因为炎帝和黄帝分别所在的部落里，都有人支持蚩尤，也有人觉得这是不对的，善神们都帮助过人类。
轮回女神为了让炎帝再次轮回耗尽生命，虽说也有人认为是蚩尤或者共工所为，只是没有确切说法。
幸运女神曾是不输给应龙的，黄帝的左膀右臂，但也被共工所击败，让其余恶神自由惩处，下场凄惨，但结局不知，彻底失踪，黄帝寻找多年无果。
善神们不到十个了，只能请求炎帝帮忙，因为在善神眼里和她们交往最深的就是炎帝了，另外炎帝的好心肠可是闻名于天下。
有一说一，无论是在炎帝消失时不断支援神农氏，还是因为炎帝出面而得以保全的善神，主兵之神还真给足了炎帝面子，不过黄帝就不一样了。
黄帝和蚩尤都有争夺天下的雄心，不过九黎部落是强盛时期，而主兵之神一心想要把神杀光，到最后愈演愈烈，主兵之神当得到共工这四姓家奴的帮助后决定彻底涿鹿中原，最多保留炎帝和他的姜姓部落。
四大主神和黄帝软磨硬泡之下，加之炎帝劝解过蚩尤多次，善神之所以是善神是心肠软，不会为祸世间，蚩尤认为神高高在上主宰世间万物，它炼化了众神长生不老，对神具有不包容心态，炎帝和黄帝终究是人，会有一死，却也没轮回女神让他们转世轮回了，种种因素之下炎帝选择联手轩辕部落击败蚩尤。
殊不知，黄帝有了更为疯狂的想法，直接把九黎部落一锅端！
若取天下，先灭人神第一的主兵之神，还世间太平，融合部落，教化万众。
此生不达该目的，纵使长生也枉然。